El periodista estadounidense Daniel Pearl, quien cubría el sur de Asia para el Wall Streer Journal, ‎fue secuestrado en Pakistán, en enero de 2002, mientras realizaba una investigación sobre los ‎supuestos vínculos de Richard Reid –el llamado «shoe bomber»– con al-Qaeda. Finalmente, ‎Daniel Pearl fue decapitado por sus secuestradores, que se identificaban como miembros del ‎Movimiento Nacional para la Restauración de la Soberanía Pakistaní. ‎

El general Iyaz Ahmed Shah, entonces jefe de los servicios de inteligencia pakistaníes (ISI) y hoy ‎ministro del Interior, declaró en aquel momento que el jefe del mencionado grupúsculo, Ahmed Omar ‎Saeed Sheikh, había confesado su crimen y que se había sometido a un régimen de prisión ‎domiciliaria. Posteriormente, fue condenado a muerte, pero un segundo tribunal ‎conmutó la pena capital ya pronunciada, reduciéndola a cadena perpetua. ‎

Khalid Sheikh Mohamed, secuestrado por los militares estadounidenses y enviado al campo de ‎detención instaurado en la base naval que Estados Unidos mantiene ilegalmente en la región ‎cubana de Guantánamo, confesó haber decapitado personalmente a Daniel Pearl. ‎En Guantánamo, Khalid Sheik Mohamed fue sometido por sus captores estadounidenses a ‎todo tipo de torturas –entre ellas 183 sesiones de waterboarding, tortura en la que se lleva a la ‎víctima hasta el borde del ahogamiento con agua– y dijo haber cometido 31 crímenes diferentes, ‎pero fue incapaz de proporcionar la menor información sobre las circunstancias de estos. ‎

El ex presidente de Pakistán, Pervez Musharraf, actualmente exiliado en Emiratos Árabes Unidos, ‎afirma en sus memorias que Ahmed Omar Saeed Sheikh en realidad era un agente del MI6 británico ‎y posiblemente un agente doble del ISI pakistaní. Según Musharraf, Ahmed Omar Saeed Sheikh ‎participó también en la guerra de Bosnia-Herzegovina. ‎

El 2 de abril de 2020, el Alto Tribunal de Pakistán conmutó sorpresivamente la pena de cadena ‎perpetua dictada contra Ahmed Omar Saeed Sheikh, dejándola en 7 años de cárcel. Después de ‎haber pasado 18 años en prisión, esa decisión implica que Ahmed Omar Saeed Sheikh sería ‎liberado próximamente. ‎

Ahmed Omar Saeed Sheikh fue un alumno brillante en la London School of Economics, practica ‎artes marciales, juega ajedrez y habla 5 idiomas. En 1994 participó en el secuestro de turistas ‎californianos registrado en la India, supuestamente en el marco de su lucha por la independencia ‎de Cachemira. Entonces fue encarcelado, pero fue liberado en 1999, a cambio de los ‎rehenes del vuelo 814 de Indian Airlines. ‎

Según el Washington Post, Ahmed Omar Saeed Sheikh era un agente de la inteligencia pakistaní, ‎que incluso le pagó durante todo el tiempo que estuvo preso en la India. ‎

Según CNN, fue Ahmed Omar Saeed Sheikh quien hizo llegar 100 000 dólares a Mohamed Atta, ‎acusado por el FBI de haber participado en el secuestro de uno de los aviones de pasajeros ‎implicados en los acontecimientos del 11 de septiembre de 2001, a pesar de que en la lista de ‎pasajeros no aparece ningún Mohamed Atta. ‎