Le plan israélien de retrait unilatéral des territoires occupés a été notamment conçu pour ouvrir une guerre civile parmi les Palestiniens. D’ores et déjà, le président de l’Autorité palestinienne, Yasser Arafat, tente de réunir au sein d’une même formation les différentes factions afin de les placer sous un commandement centralisé. Mais il se heurte à d’importantes oppositions : le Hamas, dont Israël a assassiné les leaders les plus modérés, a annoncé qu’il continuerait à mener des attentats contre l’État hébreu même après l’application du plan de retrait, ce qui exclut l’intégration de ses hommes au sein d’une force de sécurité palestinienne unifiée. Les dirigeants des Brigades des Martyrs d’Al-Aqsa ont également annoncé leur refus de participer à une telle force, et menacé ouvertement de quitter le Fatah.